RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CRBNQ96SW2 442 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CD93Q9NPY3 652 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 INIPQ9NRY2 104 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 IL20Q9NYY1 176 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAI1Q9UI46 699 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AP3B1O00203 1094 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP33O14559 1287 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE6AP16499 860 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 VAMP1P23763 118 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CD86P42081 329 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GNAQP50148 359 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 STK11Q15831 433 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TKFCQ3LXA3 575 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HYIQ5T013 277 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.629e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-213ENST00000496055 LSMEM2Q8N112 164 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TBCBQ99426 244 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO10Q9UK96 956 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NOD1Q9Y239 953 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC3O15379 428 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K6O95382 1288 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BPIFB4P59827 614 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXK1P85037 733 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT71Q3SY84 523 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LUZP1Q86V48 1076 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM160B2Q86V87 743 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 ELF2Q15723 593 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 FEM1BQ9UK73 627 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GPC3P51654 580 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SKOR1P84550 965 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE3CQ15386 1083 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R7Q15435 360 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP14Q86W24 1093 aa4.92□□□□□ -1.62
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