RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495394.1

RPSA-209, Transcript of ribosomal protein SA, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPSA, Length 2,058 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSA-209ENST00000495394 SULT2A1Q06520 285 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ZNF124Q15973 351 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 SLC44A4Q53GD3 710 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 KRT26Q7Z3Y9 468 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ARHGAP18Q8N392 663 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PPM1MQ96MI6 270 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ERP44Q9BS26 406 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TPK1Q9H3S4 243 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 EHD3Q9NZN3 535 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MYO1AQ9UBC5 1043 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CAPN14A8MX76 684 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ERVV-2B6SEH9 535 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PDE8AO60658 829 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 NAGAP17050 411 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 KRT4P19013 534 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 LMAN1P49257 510 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CLCN4P51793 760 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 BPIFB4P59827 614 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 COG7P83436 770 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 NDUFA5Q16718 116 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CCDC81Q6ZN84 652 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 GALNT7Q86SF2 657 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PPM1NQ8N819 430 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 SCAIQ8N9R8 606 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 OR6P1Q8NGX9 317 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PLBD2Q8NHP8 589 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 RFWD2Q8NHY2 731 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 FAM200AQ8TCP9 573 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CASP10Q92851 521 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ACSBG1Q96GR2 724 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MED30Q96HR3 178 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CAMKK2Q96RR4 588 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 DPP7Q9UHL4 492 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 LY75O60449 1722 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 NUP188Q5SRE5 1749 aa10□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PAPPAQ13219 1627 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 KMOO15229 486 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ALADP13716 330 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PRKACAP17612 351 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TFEBP19484 476 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 KRT85P78386 507 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CENPCQ03188 943 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 FUT2Q10981 343 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 SLC51BQ86UW2 128 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CCDC42Q96M95 316 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 YME1L1Q96TA2 773 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CDH19Q9H159 772 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ZFATQ9P243 1243 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 LRRD1A4D1F6 860 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 H3BRB1 525 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 PFDN1O60925 122 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 CYP3A4P08684 503 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MPP1Q00013 466 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MTMR3Q13615 1198 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 MMEL1Q495T6 779 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 VPS36Q86VN1 386 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 TSPYL6Q8N831 410 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 AGR3Q8TD06 166 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSA-209ENST00000495394 IFT81Q8WYA0 676 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms