RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 PLS3P13797 630 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 LTBRP36941 435 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CLUL1Q15846 466 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ATF7IP2Q5U623 682 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TMC7Q7Z402 723 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 IGSF21Q96ID5 467 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 REEP2Q9BRK0 252 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PANK2Q9BZ23 570 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KCND2Q9NZV8 630 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GDAQ9Y2T3 454 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MYH11P35749 1972 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 INPPL1O15357 1258 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 NCK2O43639 380 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TBX10O75333 385 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RECQL4O94761 1208 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 F13A1P00488 732 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ALDH2P05091 517 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 KRT18P05783 430 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 CA8P35219 290 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 VPS52Q8N1B4 723 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GSTCDQ8NEC7 633 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-214ENST00000490425 F8W810 466 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 NRP1O14786 923 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 SPTLC2O15270 562 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 FAM13AO94988 1023 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 CXCL14O95715 111 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 DDIT3P35638 169 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 TXLNAP40222 546 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 OR1G1P47890 313 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 NDUFV1P49821 464 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 SMTNP53814 917 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 ADAM15Q13444 863 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 GIT2Q14161 759 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB33Q86T24 672 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 MYCT1Q8N699 235 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 EFHBQ8N7U6 833 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 RABGGTAQ92696 567 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 RPS6KC1Q96S38 1066 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 CDT1Q9H211 546 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 MARCH5Q9NX47 278 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 A0A087X0B3 334 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 PTGESO14684 152 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 GLP2RO95838 553 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 IL9P15248 144 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 OSTNP61366 133 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 DSC1Q08554 894 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 STRN3Q13033 797 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 DUSP6Q16828 381 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.19□□□□□ -0.3
NISCH-214ENST00000490425 DYMQ7RTS9 669 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms