RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 MTHFRP42898 656 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLK1-211ENST00000481641 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
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CLK1-211ENST00000481641 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLK1-211ENST00000481641 B3GALT6Q96L58 329 aa20.53■□□□□ 0.88
CLK1-211ENST00000481641 FBXL18Q96ME1 805 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLK1-211ENST00000481641 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.48■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 CHST7Q9NS84 486 aa20.48■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.48■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.48■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 PTGESO14684 152 aa20.47■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 RECQL4O94761 1208 aa20.47■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 BRD1O95696 1058 aa20.47■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 ADH1AP07327 375 aa20.47■□□□□ 0.87
CLK1-211ENST00000481641 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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