RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481229.1

PNISR-208, Transcript of PNN interacting serine and arginine rich protein, humanhuman

TSL 3

Gene PNISR, Length 395 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNISR-208ENST00000481229 CCDC142Q17RM4 750 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 SYT12Q8IV01 421 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 DRC1Q96MC2 740 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 FANCLQ9NW38 375 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 ZMYM3Q14202 1370 aa6.53□□□□□ -1.36
PNISR-208ENST00000481229 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 B5MCH6 92 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PRAMEF4O60810 478 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 FKBP9O95302 570 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 MGAT1P26572 445 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 LCORLQ8N3X6 602 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 SNX33Q8WV41 574 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 UBXN4Q92575 508 aa6.52□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 KDM1AO60341 852 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 GASTP01350 101 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 RBP3P10745 1247 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 BROXQ5VW32 411 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ANKS6Q68DC2 871 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 SYBUQ9NX95 663 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 POGKQ9P215 609 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.51□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 KIAA0355O15063 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 TMEM127O75204 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ITGA10O75578 1167 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 AVPR1BP47901 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 DDB1Q16531 1140 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 RASSF3Q86WH2 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 COQ10AQ96MF6 247 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 TEX101Q9BY14 249 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 EMC7Q9NPA0 242 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PLAAQ9Y263 795 aa6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ZNF185O15231 689 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 HLA-DOAP06340 250 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CTSSP25774 331 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 GUCY1B3Q02153 619 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 TFAP2CQ92754 450 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 SLC5A5Q92911 643 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PIPSLA2A3N6 862 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 SPATA31D3P0C874 917 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 MDM1Q8TC05 714 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 MFSD3Q96ES6 412 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 FEZ1Q99689 392 aa6.48□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CDC45O75419 566 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 HKR1P10072 659 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 LGALS4P56470 323 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 RNF169Q8NCN4 708 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CAVIN3Q969G5 261 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 CEP95Q96GE4 821 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.47□□□□□ -1.37
PNISR-208ENST00000481229 MASP2O00187 686 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 LPLP06858 475 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 CRHR1P34998 444 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 SEC24CP53992 1094 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 BLOC1S1P78537 153 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 CT83Q5H943 113 aa6.46□□□□□ -1.38
PNISR-208ENST00000481229 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms