RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A6NJR5 290 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LRRC53A6NM62 1247 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CLDN3O15551 220 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRT86O43790 486 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOM1L1O75674 476 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AKR1A1P14550 325 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UCHL3P15374 230 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FERP16591 822 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STAT1P42224 750 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLK7P49862 253 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CAPSQ13938 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TLK2Q86UE8 772 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM50Q86XT4 487 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TCHPQ9BT92 498 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEP290O15078 2479 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NRCAMQ92823 1304 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GFPT2O94808 682 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C22orf31O95567 290 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRKCBP05771 671 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYBAP13498 195 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLRC1P26715 233 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYP24A1Q07973 514 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BAP1Q92560 729 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STK33Q9BYT3 514 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AKT3Q9Y243 479 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACKR2O00590 384 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADSSP30520 456 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGBP1P78318 339 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF5AQ12840 1032 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TUBB2AQ13885 445 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRIK4Q16099 956 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF410Q86VK4 478 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRPV1Q8NER1 839 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF592Q92610 1267 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NLRP4Q96MN2 994 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCLT1Q96NL6 688 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GANQ9H2C0 597 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0B4J269 797 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NOL4O94818 638 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF286BP0CG31 522 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM49P0CI25 452 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM49CP0CI26 452 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC9A1P19634 815 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYP2C19P33261 490 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MFAP3P55082 362 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTENP60484 403 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PSMD6Q15008 389 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM187BQ17R55 369 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WDR44Q5JSH3 913 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms