RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 NACC1Q96RE7 527 aa21.89■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.89■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 MIOSQ9NXC5 875 aa21.89■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 BRD1O95696 1058 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 AKAP5P24588 427 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 GRIK3Q13003 919 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 POTEGQ6S5H5 508 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PARP2Q9UGN5 583 aa21.88■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 A0A1B0GUA9 196 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ASGR2P07307 311 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF174Q15697 407 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 DPP7Q9UHL4 492 aa21.87■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 F8W810 466 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 TEX28O15482 410 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 GLUD1P00367 558 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 RPA1P27694 616 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 AVPR2P30518 371 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 TTC38Q5R3I4 469 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 KLK14Q9P0G3 267 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PLXNA3P51805 1871 aa21.86■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 N4BP3O15049 544 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 EFEMP2O95967 443 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 DSG1Q02413 1049 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FUT10Q6P4F1 479 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PADI6Q6TGC4 694 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PIEZO1Q92508 2521 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.85■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 MAPK6Q16659 721 aa21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FAM187BQ17R55 369 aa21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 FZD8Q9H461 694 aa21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PRKCBP05771 671 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 CYP11B2P19099 503 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 MUTP22033 750 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 NAMPTP43490 491 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 TRAPPC10P48553 1259 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 CREMQ03060 361 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 TCF15Q12870 199 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PPP2R5AQ15172 486 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 USP41Q3LFD5 358 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 DEPTORQ8TB45 409 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 BSNDQ8WZ55 320 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 B3GALT6Q96L58 329 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 CHST7Q9NS84 486 aa21.83■■□□□ 1.09
COL9A3-210ENST00000472880 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 LIG1P18858 919 aa21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 TUSC3Q13454 348 aa21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 RABGGTAQ92696 567 aa21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.82■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.088e-6■■■■■ 107
COL9A3-210ENST00000472880 TADA2AO75478 443 aa21.81■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 MYBP10242 640 aa21.81■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.81■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 GPR65Q8IYL9 337 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms