RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CASP10	Q92851	521 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SAMD11	Q96NU1	681 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PSKH2	Q96QS6	385 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MXD3	Q9BW11	206 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM5	Q9C035	493 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	VPS28	Q9UK41	221 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ENO4	A6NNW6	628 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	E2F3	O00716	465 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CETN3	O15182	167 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ACSL4	O60488	711 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH1A2	O94788	518 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CAMTA2	O94983	1202 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	UPP2	O95045	317 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SGPL1	O95470	568 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	IFNB1	P01574	187 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PSAP	P07602	524 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PDGFRA	P16234	1089 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PIK3CB	P42338	1070 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DPP6	P42658	865 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CACNB3	P54284	484 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	B2M	P61769	119 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CYP4F8	P98187	520 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DDR1	Q08345	913 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SEMA5A	Q13591	1074 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ERV3-1	Q14264	604 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	STK11	Q15831	433 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FYB2	Q5VWT5	728 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	C16orf46	Q6P387	395 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CMIP	Q8IY22	773 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	HTRA1	Q92743	480 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DHX58	Q96C10	678 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CATSPER2	Q96P56	530 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.51	□□□□□ -1.85

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