RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP45Q9UL16 551 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.88■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 H0YCG3 227 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 NCK2O43639 380 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 B4GALT3O60512 393 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 BRD1O95696 1058 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 SLC11A1P49279 550 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 SCNN1GP51170 649 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF131P52739 623 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ERVFC1P60507 584 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 STRN3Q13033 797 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 MYCT1Q8N699 235 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PANK2Q9BZ23 570 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PARVGQ9HBI0 331 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 MIOSQ9NXC5 875 aa21.87■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 CUTAO60888 179 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH2P05091 517 aa21.86■■□□□ 1.09
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CTPS1-206ENST00000470271 STAT6P42226 847 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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CTPS1-206ENST00000470271 SV2BQ7L1I2 683 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGSF21Q96ID5 467 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 SNTG2Q9NY99 539 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 KLK14Q9P0G3 267 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.86■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 A0A087X0B3 334 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 FSCN2O14926 492 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 NCKAP1LP55160 1127 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 COL19A1Q14993 1142 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TCF25Q9BQ70 676 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.85■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TRAK2O60296 914 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTPS1-206ENST00000470271 SCP2P22307 547 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DSC1Q08554 894 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTPS1-206ENST00000470271 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTPS1-206ENST00000470271 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 PDILTQ8N807 584 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 KCNN1Q92952 543 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TCHPQ9BT92 498 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 CDT1Q9H211 546 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGFLR1Q9H665 355 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 CLDND1Q9NY35 253 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 GDAQ9Y2T3 454 aa21.84■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 NRP1O14786 923 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 KCNA5P22460 613 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
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CTPS1-206ENST00000470271 NRIP1P48552 1158 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 GRIK3Q13003 919 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 SHC4Q6S5L8 630 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DYMQ7RTS9 669 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 DDX12PQ92771 950 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 TLE6Q9H808 572 aa21.83■■□□□ 1.09
CTPS1-206ENST00000470271 MYMKA6NI61 221 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 K7ENM7 598 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 NR1I2O75469 434 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TOM1L1O75674 476 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 MCF2P10911 925 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 PROZP22891 400 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 OR1G1P47890 313 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 KCNQ1P51787 676 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZPBP2Q6X784 338 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB33Q86T24 672 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 VPS52Q8N1B4 723 aa21.82■■□□□ 1.08
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