RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468255.5

CSNK2B-206, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

TSL 5

Gene CSNK2B, Length 1,792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-206ENST00000468255 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 ITGB5P18084 799 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 MMP13P45452 471 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 RWDD2BP57060 319 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 TKFCQ3LXA3 575 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 TRIM11Q96F44 468 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 NR2E1Q9Y466 385 aa16.08■□□□□ 0.17
CSNK2B-206ENST00000468255 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ASAP2O43150 1006 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ASNSP08243 561 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 MYBL1P10243 752 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CHRNB2P17787 502 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CAP2P40123 477 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 GCLMP48507 274 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PDE6CP51160 858 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PLTPP55058 493 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PSMC5P62195 406 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CDR2Q01850 454 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 MAP3K10Q02779 954 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CAV1Q03135 178 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 IFT88Q13099 833 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 MFSD5Q6N075 450 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 RDH13Q8NBN7 331 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 LPAR1Q92633 364 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 KAT2BQ92831 832 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ART4Q93070 314 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 NT5C1BQ96P26 610 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 LRRC19Q9H756 370 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 WHRNQ9P202 907 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 TRPC6Q9Y210 931 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SNX24Q9Y343 169 aa16.08■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PPIP5K2O43314 1243 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 FDX1P10109 184 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 DRD4P21917 467 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SCP2P22307 547 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ATP5DP30049 168 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 UBXN2AP68543 259 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 KRT76Q01546 638 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ITIH4Q14624 930 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 MESDQ14696 234 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF677Q86XU0 584 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PALB2Q86YC2 1186 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 VPS33BQ9H267 617 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.07■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 H0YCG3 227 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SPOPO43791 374 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CAND2O75155 1236 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SGPL1O95470 568 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 TMOD1P28289 359 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SLC1A1P43005 524 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 DLG4P78352 724 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CALCOCO2Q13137 446 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 OGFOD1Q8N543 542 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 GLG1Q92896 1179 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 NUP85Q9BW27 656 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 CNTNAP1P78357 1384 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.06■□□□□ 0.16
CSNK2B-206ENST00000468255 WDR64B1ANS9 1081 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms