RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 H0YCG3 227 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CES2O00748 559 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ENC1O14682 589 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ATP8B1O43520 1251 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SRGAP2O75044 1071 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TACC1O75410 805 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MTA2O94776 668 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GGPS1O95749 300 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IGHA2P01877 340 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ABCD1P33897 745 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 STAT1P42224 750 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GCLMP48507 274 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-9P63128 1117 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP1Q07960 439 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CAPSQ13938 189 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NEDD9Q14511 834 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PLS1Q14651 629 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD6Q15008 389 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BRD3Q15059 726 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 UBR7Q8N806 425 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 COG1Q8WTW3 980 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF516Q92618 1163 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KAT5Q92993 513 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NOX5Q96PH1 765 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FUT8Q9BYC5 575 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ISCUQ9H1K1 167 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRJQ12913 1337 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MAP2K7O14733 419 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF185O15231 689 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NCK2O43639 380 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EXTL3O43909 919 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY3O60266 1144 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MSCO60682 206 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SASH3O75995 380 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 VNN1O95497 513 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PGK2P07205 417 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM253P0C7T8 217 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CTAGE8P0CG41 777 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KRT13P13646 458 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PROZP22891 400 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NF2P35240 595 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G4AP47712 749 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MXI1P50539 228 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SMTNP53814 917 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP1BP68106 108 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DRP2Q13474 957 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SNAPC2Q13487 334 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PLCB4Q15147 1175 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZACNQ401N2 412 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MTERF2Q49AM1 385 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TEX35Q5T0J7 233 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.12□□□□□ -1.43
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