RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449194.6

PPHLN1-208, Transcript of periphilin 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPHLN1, Length 1,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPHLN1-208	ENST00000449194	JMJD7	P0C870	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CLIP1	P30622	1438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MASP2	O00187	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	FAM20B	O75063	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	APP	P05067	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CPE	P16870	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LPP	Q93052	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	NPTXR	O95502	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ASL	P04424	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SDHA	P31040	664 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	IGFALS	P35858	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PTPA	Q15257	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	APOL3	O95236	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	EYA4	O95677	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	NEK4	P51957	841 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPHLN1-208	ENST00000449194	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	KIF3B	O15066	747 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	KPNA6	O60684	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	PROZ	P22891	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	DHCR24	Q15392	516 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	LENG9	Q96B70	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPHLN1-208	ENST00000449194	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms