RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445489.1

FARP2-208, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2, human

TSL 2

Gene FARP2, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP2-208	ENST00000445489	SURF1	Q15526	300 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	KYAT1	Q16773	422 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	KRT39	Q6A163	491 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	NME8	Q8N427	588 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	TRIB2	Q92519	343 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	CCDC42	Q96M95	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	SETD4	Q9NVD3	440 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP2-208	ENST00000445489	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	SERPING1	P05155	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ADRB2	P07550	413 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MYL3	P08590	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	RARB	P10826	455 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TNNT1	P13805	278 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PROZ	P22891	400 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MXI1	P50539	228 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PRMT2	P55345	433 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	DLG4	P78352	724 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ADAM17	P78536	824 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	AKT3	Q9Y243	479 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489		A0A087WZ62	844 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	GPR25	O00155	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	OGT	O15294	1046 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	TRPA1	O75762	1119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	LCA5L	O95447	670 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ACTN1	P12814	892 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	FER	P16591	822 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	HOXC8	P31273	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	PRKCI	P41743	596 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	STAT1	P42224	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	GCLM	P48507	274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	GPC3	P51654	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MTF1	Q14872	753 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP2-208	ENST00000445489	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55

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