RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 CTSAP10619 480 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SKIP12755 728 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CDC25AP30304 524 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 AVPR2P30518 371 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 MTHFRP42898 656 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RAB27AP51159 221 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA8P51970 172 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 MTMR3Q13615 1198 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KRT79Q5XKE5 535 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CABP7Q86V35 215 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 URGCPQ8TCY9 931 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PGBD4Q96DM1 585 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KCNH3Q9ULD8 1083 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SORCS3Q9UPU3 1222 aa13.76□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SLC26A4O43511 780 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 POMCP01189 267 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SYKP43405 635 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CYP4A11Q02928 519 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PTPN14Q15678 1187 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KLHL40Q2TBA0 621 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CALML4Q96GE6 196 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PRRX2Q99811 253 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 LXNQ9BS40 222 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RSAD1Q9HA92 442 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RGL1Q9NZL6 768 aa13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 H0Y858 1186 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 C2CD2LO14523 706 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 TRAK2O60296 914 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 NR1I2O75469 434 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 DDHD2O94830 711 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 P4HBP07237 508 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KLRC2P26717 231 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 YWHABP31946 246 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 EMC2Q15006 297 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 EPHA7Q15375 998 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ATAT1Q5SQI0 421 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PDILTQ8N807 584 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RNF149Q8NC42 400 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 DYDC2Q96IM9 177 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 CACNA1HO95180 2353 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 A0A087X0B3 334 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB39O15060 712 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 KINO60870 393 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ZNF623O75123 536 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 ZNF202O95125 648 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 MYBP10242 640 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 PLCG1P19174 1290 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RPA1P27694 616 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RFC5P40937 340 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 GIT2Q14161 759 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 XKR9Q5GH70 373 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 HYIQ5T013 277 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 UBXN11Q5T124 520 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 UBALD2Q8IYN6 164 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-208ENST00000438888 IQUBQ8NA54 791 aa13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms