RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	NUDT3	O95989	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	HLA-DOA	P06340	250 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LGALS4	P56470	323 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TAP1	Q03518	808 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	UGT8	Q16880	541 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	PCSK4	Q6UW60	755 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LCORL	Q8N3X6	602 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	AHRR	A9YTQ3	701 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ULK1	O75385	1050 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ITGA10	O75578	1167 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GAST	P01350	101 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LPL	P06858	475 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	RBP3	P10745	1247 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	NHLH2	Q02577	135 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	DHCR24	Q15392	516 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CT83	Q5H943	113 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF480	Q8WV37	535 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TFAP2C	Q92754	450 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TTC1	Q99614	292 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	NCR1	O76036	304 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	NDUFA10	O95299	355 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	AVPR1B	P47901	424 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	SESN3	P58005	492 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	MDM1	Q8TC05	714 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ACAP3	Q96P50	834 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LEFTY2	O00292	366 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZEB2	O60315	1214 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	PHF2	O75151	1096 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CTSS	P25774	331 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	RAX2	Q96IS3	184 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A087X0B3	334 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CRHR1	P34998	444 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM189B	P81408	668 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TOR3A	Q9H497	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	ENPP3	O14638	875 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LPXN	O60711	386 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM127	O75204	238 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	BPI	P17213	487 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	PTPN7	P35236	360 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GUCY1B3	Q02153	619 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	STRN3	Q13033	797 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR150	Q8NGU9	434 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	CAVIN3	Q969G5	261 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	DPP7	Q9UHL4	492 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PTPN4-204	ENST00000431283	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		6.52	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms