RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.65■■□□□ 1.06
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LTB-210ENST00000429299 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 NPEPPSP55786 919 aa21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 NLRP5P59047 1200 aa21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 GPC5P78333 572 aa21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 CREMQ03060 361 aa21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 USP41Q3LFD5 358 aa21.64■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 GAD1Q99259 594 aa21.64■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 CEP170P1Q96L14 293 aa21.63■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.63■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 ERLIN2O94905 339 aa21.62■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 MLH1P40692 756 aa21.62■■□□□ 1.05
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LTB-210ENST00000429299 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 FAM20AQ96MK3 541 aa21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 HES2Q9Y543 173 aa21.59■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 FAM170BA6NMN3 283 aa21.58■■□□□ 1.05
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