RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VILL	O15195	856 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLCG2	P16885	1265 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GTF2H1	P32780	548 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXO4	P98177	505 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIPK2	O43353	540 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPING1	P05155	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL6A2	P12110	1019 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LIFR	P42702	1097 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARID5A	Q03989	594 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RTN1	Q16799	776 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FNDC8	Q8TC99	324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STMN2	Q93045	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BIRC5	O15392	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPINB7	O75635	380 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DR1	Q01658	176 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DSG1	Q02413	1049 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSC2	O15499	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF862	O60290	1169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCTN3	O75935	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE5A	O76074	875 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGG	P02679	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRAF	P15056	766 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT2	P35908	639 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK4	Q13043	487 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APPBP2	Q92624	585 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NTSR2	O95665	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCR3	P51677	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE1B	Q01064	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MOGS	Q13724	837 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLIN2	Q99541	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOC3	O60645	756 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRDM1	O75626	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPINB8	P50452	374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms