RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIOSQ9NXC5 875 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR1I2O75469 434 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFHP08603 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYBP10242 640 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPSQ13938 189 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANGPT1Q15389 498 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMHR2Q16671 573 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOL6Q9BWW8 343 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST7Q9NS84 486 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.65□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLITRK3O94933 977 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAPLNO95428 1278 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXK2Q01167 660 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU5F1BQ06416 359 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUT10Q6P4F1 479 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPH2Q8IWU9 490 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HACE1Q8IYU2 909 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYADMQ96S97 322 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT16Q9UBV4 365 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.64□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRBA1A5PL33 1030 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM205CA6NFA0 338 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGAT1O75907 488 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPLA2O95372 231 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1RP00736 705 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PALB2Q86YC2 1186 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GALT6Q96L58 329 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALT5O43286 388 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGM5O43548 720 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFKFB2O60825 505 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTNBO60941 627 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA31D3P0C874 917 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRFP11831 508 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFX1P22670 979 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP5P24588 427 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL2P36404 184 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIK3Q13003 919 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR5A1Q13285 461 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP41Q3LFD5 358 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR65Q8IYL9 337 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADSSL1Q8N142 457 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXPE3Q969Y0 559 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIDD1Q9HB75 910 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNIP2Q9P278 1114 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA14Q9ULX7 337 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.63□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK25O00506 426 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPTXRO95502 500 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLRA2P23416 452 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT2P35908 639 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREMQ03060 361 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF25Q93038 417 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.62□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTDNEP1O95476 244 aa14.61□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMP2P13473 410 aa14.61□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RARRES1P49788 294 aa14.61□□□□□ -0.07
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALCRLQ16602 461 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms