RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 KLHL33A6NCF5 533 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PCDH8O95206 1070 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PF4V1P10720 104 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ATF3P18847 181 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GNALP38405 381 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 KIR2DL3P43628 341 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 MAN2A2P49641 1150 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 FHL2Q14192 279 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MLC1Q15049 377 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CT83Q5H943 113 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 FKBP15Q5T1M5 1219 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 KCNK18Q7Z418 384 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 KCNG1Q9UIX4 513 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MYPNQ86TC9 1320 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PRSS38A1L453 326 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 NRP1O14786 923 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MTSS1O43312 755 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 SUV39H1O43463 412 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 XPOTO43592 962 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 MFAP3LO75121 409 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 AGXTP21549 392 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 TGFB2P61812 414 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 UGT8Q16880 541 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 TOR2AQ5JU69 321 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 TPH2Q8IWU9 490 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CEP72Q9P209 647 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GOLGA6CA6NDK9 693 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GOLGA6BA6NDN3 693 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 NRP2O60462 931 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PEX11BO96011 259 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 PFKMP08237 780 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ADH4P08319 380 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GAAP10253 952 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 VCAM1P19320 739 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 MAKP20794 623 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CYP2C19P33261 490 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 SCNN1GP51170 649 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-207ENST00000418674 SPIDRQ14159 915 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 ACAP2Q15057 778 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CLUL1Q15846 466 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 Q6ZRM9 215 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 AMER2Q8N7J2 671 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-207ENST00000418674 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
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