RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 E2F5Q15329 346 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TC2NQ8N9U0 490 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SNF8Q96H20 258 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 HAUS8Q9BT25 410 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 EFHC2Q5JST6 749 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH6P55285 790 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 URGCPQ8TCY9 931 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0G2JND7 137 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TADA3O75528 432 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ROR1Q01973 937 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ADGRB1O14514 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PPM1NQ8N819 430 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SPDYE6P0CI01 402 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ART3Q13508 389 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 GGA3Q9NZ52 723 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC1A1P43005 524 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 EXT2Q93063 718 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 DCTN3O75935 186 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TAC1P20366 129 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP2R2AP63151 447 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 NME3Q13232 169 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 POLIQ9UNA4 740 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 BRAFP15056 766 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9A1P19634 815 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 TNIP3Q96KP6 325 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS11Q9H270 941 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF185O15231 689 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 CFLARO15519 480 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 PRKCEQ02156 737 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.7■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 C18orf8Q96DM3 657 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 SPON1Q9HCB6 807 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC36A6NLP5 189 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MAFGO15525 162 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NCOA4Q13772 614 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO41Q8TF61 875 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.69■■□□□ 1.22
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