RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 NCK2O43639 380 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 B4GALT3O60512 393 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC11A1P49279 550 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 SCNN1GP51170 649 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF131P52739 623 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 HYAL1Q12794 435 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 STRN3Q13033 797 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 IGFLR1Q9H665 355 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PARVGQ9HBI0 331 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 H0YCG3 227 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 FSCN2O14926 492 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 STAT6P42226 847 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NCKAP1LP55160 1127 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 AAK1Q2M2I8 961 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 DYMQ7RTS9 669 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PDILTQ8N807 584 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM169Q96HH4 297 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 IGSF21Q96ID5 467 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TCHPQ9BT92 498 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NRP1O14786 923 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAK2O60296 914 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.39e-7■■■■■ 27
SH3BP4-204ENST00000416021 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 SHC4Q6S5L8 630 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TMC7Q7Z402 723 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX12PQ92771 950 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TCF25Q9BQ70 676 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 GDAQ9Y2T3 454 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0C4DFX4 3053 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 MYMKA6NI61 221 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1G1P47890 313 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ME1P48163 572 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB33Q86T24 672 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TLE6Q9H808 572 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 REV3LO60673 3130 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 RECQL4O94761 1208 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PROZP22891 400 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NRIP1P48552 1158 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 DSC1Q08554 894 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 COL19A1Q14993 1142 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNN1Q92952 543 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CDT1Q9H211 546 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDND1Q9NY35 253 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TBX20Q9UMR3 447 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PER2O15055 1255 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NR1I2O75469 434 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL14O95715 111 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SCP2P22307 547 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNA5P22460 613 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM15Q13444 863 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ZPBP2Q6X784 338 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS52Q8N1B4 723 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 FIZ1Q96SL8 496 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 HIDE1A8MVS5 230 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 K7ENM7 598 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ABLIM1O14639 778 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TOM1L1O75674 476 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MCF2P10911 925 aa23.13■■□□□ 1.29
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