RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 RESTQ13127 1097 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TTC23LQ6PF05 361 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 OLFM4Q6UX06 510 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SPATA24Q86W54 205 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HERVK_113Q902F9 699 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 AIFM3Q96NN9 605 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 PLVAPQ9BX97 442 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 KRT23Q9C075 422 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NYXQ9GZU5 481 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 C12orf10Q9HB07 376 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LZTS1Q9Y250 596 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 UTRNP46939 3433 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ENPP3O14638 875 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HSF2BPO75031 334 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CDK4P11802 303 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GZMAP12544 262 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CTRB1P17538 263 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CDC27P30260 824 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MAN1A1P33908 653 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SEPT6Q14141 434 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CORO6Q6QEF8 472 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 AADATQ8N5Z0 425 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 USP38Q8NB14 1042 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MYH2Q9UKX2 1941 aa7.22□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CTAGE9A4FU28 777 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 VAV1P15498 845 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 WEE1P30291 646 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RCAN1P53805 252 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CETN1Q12798 172 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TXNRD1Q16881 649 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CDONQ4KMG0 1287 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LIN52Q52LA3 116 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GALNT7Q86SF2 657 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HACE1Q8IYU2 909 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CADM3Q8N126 398 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NATD1Q8N6N6 113 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NCOA7Q8NI08 942 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 OLFM3Q96PB7 478 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 C8orf4Q9NR00 106 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 THAP1Q9NVV9 213 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.21□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM114B3SHH9 223 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 NCK2O43639 380 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 ADAM23O75077 832 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 KATNA1O75449 491 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 MAP3K6O95382 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 SERPINB2P05120 415 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 ALAS1P13196 640 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 CPA3P15088 417 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 ME1P48163 572 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 RAD23BP54727 409 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 SNX16P57768 344 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.21□□□□□ -1.26
LRRTM4-205ENST00000409911 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms