RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400926.5

CCR6-203, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCR6, Length 3,216 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-203ENST00000400926 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.61□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CCDC169A6NNP5 214 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 TOM1L1O75674 476 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 MCF2P10911 925 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SMTNP53814 917 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 ADSSL1Q8N142 457 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CXorf38Q8TB03 319 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CWH43Q9H720 699 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GRM5P41594 1212 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 RAB27AP51159 221 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CENPPQ6IPU0 288 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 BORCS6Q96GS4 357 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PTGESO14684 152 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 OFD1O75665 1012 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PRCPP42785 496 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 ZBTB6Q15916 424 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 MIOSQ9NXC5 875 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GINS2Q9Y248 185 aa9.6□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 LCHNA4D1U4 455 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 KINO60870 393 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GCNT3O95395 438 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GARTP22102 1010 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GATMP50440 423 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CEP120Q8N960 986 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 ACCSQ96QU6 501 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CNTN3Q9P232 1028 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 NPTXRO95502 500 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 MBD3O95983 291 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 ACTN1P12814 892 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 TNFSF9P41273 254 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CLDN10P78369 228 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 SNX27Q96L92 541 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PBX4Q9BYU1 374 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.59□□□□□ -0.87
CCR6-203ENST00000400926 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 ERLIN2O94905 339 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 IDEP14735 1019 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 DSC1Q08554 894 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 CAMK4Q16566 473 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 SPRED2Q7Z698 418 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 LPPQ93052 612 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 TMEM206Q9H813 350 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 EXOC1Q9NV70 894 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 HES2Q9Y543 173 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 TTC26A0AVF1 554 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 PDXKO00764 312 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 AMHP03971 560 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 PBX2P40425 430 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.58□□□□□ -0.88
CCR6-203ENST00000400926 SMARCE1Q969G3 411 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms