RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381007.8

SGTB-201, Transcript of small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGTB, Length 5,469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTB-201ENST00000381007 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 MYBP10242 640 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TAC1P20366 129 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 VPS72Q15906 364 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 LCA5Q86VQ0 697 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 AFG1LQ8WV93 481 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PARVAQ9NVD7 372 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SLC9A1P19634 815 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 FMO5P49326 533 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CCZ1BP86790 482 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 MS4A14Q96JA4 679 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 MYBL1P10243 752 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PPP2R2AP63151 447 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 NR1H3Q13133 447 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 GYG2O15488 501 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 DCTN3O75935 186 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 RARBP10826 455 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 NCAPHQ15003 741 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 KIF19Q2TAC6 998 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 COG1Q8WTW3 980 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ACAP3Q96P50 834 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 STK33Q9BYT3 514 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PHEXP78562 749 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ROR1Q01973 937 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PID1Q7Z2X4 250 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TTC39CQ8N584 583 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 MORC4Q8TE76 937 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 IFT43Q96FT9 208 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CCDC138Q96M89 665 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 GMNCA6NCL1 334 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TBX3O15119 743 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TADA3O75528 432 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 NR1I3Q14994 352 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 E2F4Q16254 413 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 KRT80Q6KB66 452 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 FAM151AQ8WW52 585 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SERPINI1Q99574 410 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 RTN2O75298 545 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SKIP12755 728 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 LCP1P13796 627 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 KLRK1P26718 216 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ARSEP51690 589 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 C18orf8Q96DM3 657 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SUN2Q9UH99 717 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 AP3M2P53677 418 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TROAPQ12815 778 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 KRT82Q9NSB4 513 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.62□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SMARCA1P28370 1054 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 COPS2P61201 443 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 KRT17Q04695 432 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGTB-201ENST00000381007 SNF8Q96H20 258 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms