RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CYP26A1O43174 497 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 RARGP13631 454 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PPP1R7Q15435 360 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CLUL1Q15846 466 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CEP55Q53EZ4 464 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MSL1Q68DK7 614 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 NUP85Q9BW27 656 aa20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MGARPQ8TDB4 240 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ACER1Q8TDN7 264 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ATP6V1G2O95670 118 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 FMO1Q01740 532 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 NEDD9Q14511 834 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PADI6Q6TGC4 694 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.19■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SPOPO43791 374 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MTA2O94776 668 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ACSL3O95573 720 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CALCAP01258 141 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CHKAP35790 457 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SEMA4DQ92854 862 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PARP2Q9UGN5 583 aa20.18■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CLDN3O15551 220 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 GGPS1O95749 300 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ADRB2P07550 413 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 POLR2MP0CAP2 368 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 STAT2P52630 851 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SNX1Q13596 522 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SLMAPQ14BN4 828 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MFSD5Q6N075 450 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 NOD2Q9HC29 1040 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 KCND2Q9NZV8 630 aa20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TMEM150BA6NC51 233 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 DACT2Q5SW24 774 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 VSTM1Q6UX27 236 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TCP11Q8WWU5 503 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ZNF653Q96CK0 615 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PASKQ96RG2 1323 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 SNX3O60493 162 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 UBOX5O94941 541 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CYP1A2P05177 515 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 GBP1P32455 592 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 RASA3Q14644 834 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 CCDC63Q8NA47 563 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.16■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 C21orf2O43822 256 aa20.15■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ECEL1O95672 775 aa20.15■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 GSTA1P08263 222 aa20.15■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ELF1P32519 619 aa20.15■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 KRT17Q04695 432 aa20.15■□□□□ 0.82
CITED2-201ENST00000367651 ACCSLQ4AC99 568 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms