RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 BRAPQ7Z569 592 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GJD3Q8N144 294 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 VPS52Q8N1B4 723 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 IFT74Q96LB3 600 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP42Q96MM3 310 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GAD1Q99259 594 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ZBP1Q9H171 429 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FZD8Q9H461 694 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CD320Q9NPF0 282 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 DNM3Q9UQ16 869 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 N4BP3O15049 544 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 HIP1RO75146 1068 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 BMP15O95972 392 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 EDN1P05305 212 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP5P24588 427 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 EFNA5P52803 228 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KCNC3Q14003 757 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK18Q7Z418 384 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.067e-7■■■■□ 21.6
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SGMS1-201ENST00000361543 DRC1Q96MC2 740 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 POLD4Q9HCU8 107 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 STK39Q9UEW8 545 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.45□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 VWA8A3KMH1 1905 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC169A6NNP5 214 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ACKR2O00590 384 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NRP1O14786 923 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K13O43283 966 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 PEX3P56589 373 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 DSC1Q08554 894 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GRIK3Q13003 919 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GIT2Q14161 759 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN14Q15678 1187 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 HYIQ5T013 277 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CABP7Q86V35 215 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 DAW1Q8N136 415 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CASP10Q92851 521 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 AK8Q96MA6 479 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 PNMA5Q96PV4 448 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TIPINQ9BVW5 301 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MARCH5Q9NX47 278 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KLK14Q9P0G3 267 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 PARP2Q9UGN5 583 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 USP20Q9Y2K6 914 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 IRAK3Q9Y616 596 aa8.44□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FRYLO94915 3013 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 F8W810 466 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A4O43511 780 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NR1I2O75469 434 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RECQL4O94761 1208 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 URODP06132 367 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GUCY2CP25092 1073 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NPTX2P47972 431 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK7Q13164 816 aa8.43□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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