RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 NR3C1P04150 777 aa11.19□□□□□ -0.62
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CLN8-201ENST00000331222 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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CLN8-201ENST00000331222 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.18□□□□□ -0.62
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CLN8-201ENST00000331222 ABCB6Q9NP58 842 aa11.18□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.18□□□□□ -0.62
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CLN8-201ENST00000331222 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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CLN8-201ENST00000331222 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.17□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.17□□□□□ -0.62
CLN8-201ENST00000331222 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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