RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 YIPF3Q9GZM5 350 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TLE6Q9H808 572 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 DMAC2Q9NW81 257 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CEP350Q5VT06 3117 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MROH7Q68CQ1 1323 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ENO4A6NNW6 628 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB5O15062 677 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ECE2O60344 883 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CDH16O75309 829 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GH1P01241 217 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PYGMP11217 842 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GZMAP12544 262 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 COMTP21964 271 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 IVDP26440 423 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MAN1A1P33908 653 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PSMC6P62333 389 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SETDB1Q15047 1291 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SEPT12Q8IYM1 358 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RNF217Q8TC41 542 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PITPNM3Q9BZ71 974 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.07□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LRRD1A4D1F6 860 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FSCN2O14926 492 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FTLP02792 175 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KCNA4P22459 653 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RASSF2P50749 326 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RAB27AP51159 221 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 IL9RQ01113 521 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MOGSQ13724 837 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 Q4G0T1 1027 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FAM13CQ8NE31 585 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LMO3Q8TAP4 145 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TSC22D3Q99576 134 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MYLK2Q9H1R3 596 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 DNAJC18Q9H819 358 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 UBN1Q9NPG3 1134 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 USP20Q9Y2K6 914 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MAPK13O15264 365 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 DCTN3O75935 186 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GCNT3O95395 438 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ACSL3O95573 720 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GM2AP17900 193 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FOXN2P32314 431 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 STAT3P40763 770 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 BTDP43251 543 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TRAF1Q13077 416 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NR1H3Q13133 447 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 AP3B2Q13367 1082 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PTK6Q13882 451 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MYBPC2Q14324 1141 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 STAT4Q14765 748 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GRIK5Q16478 980 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD35Q8N283 1001 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FAM136AQ96C01 138 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SNF8Q96H20 258 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NLRP3Q96P20 1036 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 JAG2Q9Y219 1238 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CHKBQ9Y259 395 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SBF2Q86WG5 1849 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CLIC2O15247 247 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SORBS3O60504 671 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ASMTLO95671 621 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ABHD2P08910 425 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 BCRP11274 1271 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms