RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.7■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.7■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.7■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ZNF233A6NK53 670 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 CYP26A1O43174 497 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 CEP104O60308 925 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NF2P35240 595 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 STRN3Q13033 797 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NT5C1BQ96P26 610 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ACP6Q9NPH0 428 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 EXTL3O43909 919 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PGK2P07205 417 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 CHRNB2P17787 502 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NAMPTP43490 491 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 LY6KQ17RY6 165 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 HES6Q96HZ4 224 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 KRT12Q99456 494 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ISCUQ9H1K1 167 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 GGPS1O95749 300 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TGFB3P10600 412 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 STAT5BP51692 787 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ENPEPQ07075 957 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 DEPTORQ8TB45 409 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 KCNN1Q92952 543 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 FAM84AQ96KN4 292 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 AMFRQ9UKV5 643 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 COG5Q9UP83 839 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.68■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SLC25A27O95847 323 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TAF3Q5VWG9 929 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.67■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 GLI1P08151 1106 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PPIL2Q13356 520 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 MOGSQ13724 837 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 Q3C1V9 767 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 METTL7BQ6UX53 244 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ZNF516Q92618 1163 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 FGD4Q96M96 766 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 K7ERI5 159 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 RFC5P40937 340 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TATDN2Q93075 761 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SOCS7O14512 581 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ARIH2O95376 493 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TNFRSF8P28908 595 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SCFD2Q8WU76 684 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 OPTNQ96CV9 577 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 RTN2O75298 545 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PIGRP01833 764 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SCP2P22307 547 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 ACOT2P49753 483 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 WNT7BP56706 349 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 TNNC1P63316 161 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 CLDN10P78369 228 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PSMD6Q15008 389 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 CCDC102AQ96A19 550 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SYT17Q9BSW7 474 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 SIP14410 1827 aa24.64■■□□□ 1.54
SNX18-201ENST00000326277 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 MMEP08473 750 aa24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CYP11B1P15538 503 aa24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms