RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.85□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 HIPK3Q9H422 1215 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.85□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 OGTO15294 1046 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 EXTL3O43909 919 aa14.84□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 AKAP3O75969 853 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 GHRP10912 638 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 KCNJ12Q14500 433 aa14.84□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 CEP135Q66GS9 1140 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.84□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF18-201ENST00000320054 PADI3Q9ULW8 664 aa14.84□□□□□ -0.03
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PRPF18-201ENST00000320054 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.83□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 ATP1A3P13637 1013 aa14.83□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 CD52P31358 61 aa14.83□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 MRE11P49959 708 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 SARM1Q6SZW1 724 aa14.83□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.83□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.83□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 LTBP2Q14767 1821 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF233A6NK53 670 aa14.82□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 DSC3Q14574 896 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 GPNMBQ14956 572 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 UBXN11Q5T124 520 aa14.82□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.82□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 CYP2C18P33260 490 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 GRM5P41594 1212 aa14.81□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 FANCCQ00597 558 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 KRT31Q15323 416 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 MAN2A1Q16706 1144 aa14.81□□□□□ -0.04
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PRPF18-201ENST00000320054 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TMC2Q8TDI7 906 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TMX1Q9H3N1 280 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 ADRB2P07550 413 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF18-201ENST00000320054 TPM2P07951 284 aa14.8□□□□□ -0.04
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