RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR182O15218 404 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM60Q495X7 471 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDZD7Q9H5P4 517 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GUA9 196 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK13O15264 365 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROZP22891 400 aa29.9■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS16Q9H269 839 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC10BA6NIK2 292 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF233A6NK53 670 aa29.89■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OGTO15294 1046 aa29.89■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1DP3Q658K8 133 aa29.89■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADCY5O95622 1261 aa29.88■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GHRP10912 638 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SELPP16109 830 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2R3AQ06190 1150 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBL2Q08999 1139 aa29.88■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO47Q5MNV8 452 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP37Q86T82 979 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAPLN2Q9GZV7 340 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDT1Q9H211 546 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa29.87■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC27A1Q6PCB7 646 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC8DQ7L1W4 858 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM59Q8IWR1 403 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PITPNM1O00562 1244 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABLIM1O14639 778 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT2P49753 483 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GTH6 734 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BORCS6Q96GS4 357 aa29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIPK3Q9H422 1215 aa29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPTXRO95502 500 aa29.84■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD52P31358 61 aa29.84■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa29.84■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LGALS16A8MUM7 142 aa29.83■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM39AQ9NV64 488 aa29.83■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.83■■■□□ 2.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSTNP61366 133 aa29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR1I3Q14994 352 aa29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEZ6Q53EL9 994 aa29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNBP1Q96RU3 617 aa29.82■■■□□ 2.36
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