RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMP2AO43633 222 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHRNB2P17787 502 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 HADHBP55084 474 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP1B1Q16678 543 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD101Q93033 1021 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPOPO43791 374 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECEL1O95672 775 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 NSMFQ6X4W1 530 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNKSR1Q969H4 720 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPINB12Q96P63 405 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT17Q04695 432 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 Q4G0T1 1027 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FIZ1Q96SL8 496 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM196BA6NMK8 535 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SGPL1O95470 568 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 STX2P32856 288 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP11AP98196 1134 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC3O60645 756 aa23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL1R1P14778 569 aa23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TISP43B9A030 160 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 O00370 1275 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 GAP43P17677 238 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARVGQ9HBI0 331 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENO4A6NNW6 628 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 GGPS1O95749 300 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXN2P32314 431 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS41P49754 854 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 BFSP1Q12934 665 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 DMAC2Q9NW81 257 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP21Q9UK80 565 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBX3O15119 743 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYDC2Q96IM9 177 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM237Q96Q45 408 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHST7Q9NS84 486 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 EMSYQ7Z589 1322 aa23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLITRK3O94933 977 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNB1P14635 433 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTF2IP78347 998 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF11Q15544 211 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP85Q9BW27 656 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC4O95801 387 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 AP3B2Q13367 1082 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM20AQ96MK3 541 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNC5CO95185 931 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCRP11274 1271 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF76P36508 570 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCLMP48507 274 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP3CAQ08209 521 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 SGO2Q562F6 1265 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLF2Q8IX21 1173 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAC1P20366 129 aa23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGA8P53708 1063 aa23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 BLMHQ13867 455 aa23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1A-201ENST00000317991 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms