RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 KLRC1P26715 233 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PSMD6Q15008 389 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SEMA4DQ92854 862 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 HAPLN2Q9GZV7 340 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PDCL3Q9H2J4 239 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 EDN1P05305 212 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 DLATP10515 647 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZPBP2Q6X784 338 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC71Q8N4P6 559 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 FBXL13Q8NEE6 735 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PPTC7Q8NI37 304 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A5Q8TAD4 765 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MAML3Q96JK9 1138 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 LGALS2P05162 132 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN10P78369 228 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 TEX35Q5T0J7 233 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0B4J269 797 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 BUB1O43683 1085 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ADCYAP1R1P41586 468 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SV2AQ7L0J3 742 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 RABGGTAQ92696 567 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MSTO1Q9BUK6 570 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MYH10P35580 1976 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SLC15A5A6NIM6 579 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SLC10A3P09131 477 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TAS1R2Q8TE23 839 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 RAB20Q9NX57 234 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 INTUQ9ULD6 942 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 RNF149Q8NC42 400 aa29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CTAGE15A4D2H0 777 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MSCO60682 206 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CTAGE8P0CG41 777 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ACOT2P49753 483 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TUBB4BP68371 445 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CTAGE6Q86UF2 777 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CTAGE4Q8IX94 777 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 NT5C1BQ96P26 610 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SNX12Q9UMY4 172 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TOMM70O94826 608 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 MFAP3P55082 362 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 GLYCTKQ8IVS8 523 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 AFG1LQ8WV93 481 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 KAT5Q92993 513 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 KREMEN1Q96MU8 473 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 FNBP1Q96RU3 617 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TINF2Q9BSI4 451 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 H2AFZP0C0S5 128 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 PRLRP16471 622 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TFDP1Q14186 410 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 H2AFVQ71UI9 128 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 PPM1KQ8N3J5 372 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 HELQQ8TDG4 1101 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 SRGAP2O75044 1071 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 C22orf31O95567 290 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 PRKCBP05771 671 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 RHPN2Q8IUC4 686 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF516Q92618 1163 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 CPA4Q9UI42 421 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD8-201ENST00000313173 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms