RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 H0YCG3 227 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PHF2O75151 1096 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF844Q08AG5 666 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 RNF146Q9NTX7 359 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PODXLO00592 558 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CYP26A1O43174 497 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PPFIA2O75334 1257 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CYP1A2P05177 515 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 LSP1P33241 339 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MAGEA9P43362 315 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PDE6CP51160 858 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CDR2Q01850 454 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SLC20A2Q08357 652 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NAA35Q5VZE5 725 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 KAT5Q92993 513 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CDHR1Q96JP9 859 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CEP170P1Q96L14 293 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MAF1Q9H063 256 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 EPN3Q9H201 632 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 DPH5Q9H2P9 285 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PIM2Q9P1W9 311 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NR2E1Q9Y466 385 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFAB1O14561 156 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NR3C2P08235 984 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 GARTP22102 1010 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF15Q66K64 600 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 HELQQ8TDG4 1101 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 RAB20Q9NX57 234 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PARP2Q9UGN5 583 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 DGAT1O75907 488 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PSAPP07602 524 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CYP11B1P15538 503 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 COMTP21964 271 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CTNNA2P26232 953 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 FMO1Q01740 532 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SEMA4DQ92854 862 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NFASCO94856 1347 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PEX5P50542 639 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 BACE1P56817 501 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CYP24A1Q07973 514 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MESDQ14696 234 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 JAMLQ86YT9 394 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ATG4CQ96DT6 458 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SAAL1Q96ER3 474 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 BCS1LQ9Y276 419 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 STAM2O75886 525 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 SCP2P22307 547 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 FLT3P36888 993 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 GPD1LQ8N335 351 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CD101Q93033 1021 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TRPC6Q9Y210 931 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MYO1FO00160 1098 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM66O15016 1216 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 MMEP08473 750 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 GCNT1Q02742 428 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 DGKZQ13574 1117 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 IFT74Q96LB3 600 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 NUP85Q9BW27 656 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 PLVAPQ9BX97 442 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 CENPHQ9H3R5 247 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-201ENST00000311008 TGFB2P61812 414 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-201ENST00000311008 GUCY1A3Q02108 690 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-201ENST00000311008 PTGISQ16647 500 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms