RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TRAK2O60296 914 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PLCB3Q01970 1234 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 UBE3AQ05086 875 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF280BQ86YH2 543 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 KLK14Q9P0G3 267 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJB4Q9UDY4 337 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TCHHQ07283 1943 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 K7ENM7 598 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SCP2P22307 547 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SCNN1GP51170 649 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 E2F4Q16254 413 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SLC39A11Q8N1S5 342 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 KCNN1Q92952 543 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA32Q96LK8 384 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PTPRHQ9HD43 1115 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SNTG2Q9NY99 539 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.42■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 CARNS1A5YM72 827 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 B4GALT3O60512 393 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DDHD2O94830 711 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 KRT17Q04695 432 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF568Q3ZCX4 644 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 RESP18Q5W5W9 173 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 IQUBQ8NA54 791 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DHX58Q96C10 678 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 CUEDC2Q9H467 287 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 MIOSQ9NXC5 875 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 THEGQ9P2T0 379 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 LZTS1Q9Y250 596 aa27.41■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 GALTP07902 379 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 IRS1P35568 1242 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SLC11A1P49279 550 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 NUCB2P80303 420 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB33Q86T24 672 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 FAM178BQ8IXR5 827 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJC19Q96DA6 116 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 RPS6KC1Q96S38 1066 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TCHPQ9BT92 498 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TLR9Q9NR96 1032 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 GDAQ9Y2T3 454 aa27.4■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 RECQL4O94761 1208 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ZPBP2Q6X784 338 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 GSTCDQ8NEC7 633 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM169Q96HH4 297 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 FIZ1Q96SL8 496 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 CDT1Q9H211 546 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TBX20Q9UMR3 447 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.39■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TOM1L1O75674 476 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ALDH2P05091 517 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 PROZP22891 400 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 NMT1P30419 496 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MPZL3Q6UWV2 235 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 SFR1Q86XK3 245 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 STAMQ92783 540 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 BICD1Q96G01 975 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM175Q9BSA9 504 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC27Q9C0I9 530 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TNMDQ9H2S6 317 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 KBTBD4Q9NVX7 518 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa27.38■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 MCF2P10911 925 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 HARSP12081 509 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 IDEP14735 1019 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 GAP43P17677 238 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ABCD1P33897 745 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ERVFC1P60507 584 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 CEP120Q8N960 986 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.37■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ABLIM1O14639 778 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 GTF2BQ00403 316 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 DSC1Q08554 894 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 GRIK3Q13003 919 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ADALQ6DHV7 355 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 COLGALT2Q8IYK4 626 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 HLA-CQ95604 372 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 IGSF21Q96ID5 467 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 KCNH3Q9ULD8 1083 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 FAN1Q9Y2M0 1017 aa27.36■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 TRIP11Q15643 1979 aa27.35■■□□□ 1.97
CXCL2-201ENST00000296031 NRP1O14786 923 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms