RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 GLUD2P49448 558 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GUA9 196 aa21.74■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 TEX28O15482 410 aa21.74■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 MED24O75448 989 aa21.74■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 ADH1AP07327 375 aa21.74■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.74■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.74■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.74■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 SEC24BO95487 1268 aa21.73■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 NACC1Q96RE7 527 aa21.73■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 KLK14Q9P0G3 267 aa21.73■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 PARP2Q9UGN5 583 aa21.73■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.73■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 C8orf76Q96K31 380 aa21.72■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 CHST7Q9NS84 486 aa21.72■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 DPP7Q9UHL4 492 aa21.72■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.72■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.71■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 OR52Z1P0C646 297 aa21.71■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 MYBP10242 640 aa21.71■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 FUT10Q6P4F1 479 aa21.71■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.71■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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CXCL3-201ENST00000296026 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.69■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 PALB2Q86YC2 1186 aa21.69■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.69■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.68■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.68■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.68■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.68■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.68■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.68■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.68■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 H0Y858 1186 aa21.67■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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CXCL3-201ENST00000296026 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 MAPK6Q16659 721 aa21.67■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 TTC38Q5R3I4 469 aa21.67■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 GPR65Q8IYL9 337 aa21.67■■□□□ 1.06
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.67■■□□□ 1.06
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