RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262305.8

RAB11FIP3-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP3, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ACER1Q8TDN7 264 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BAG2O95816 211 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ELF1P32519 619 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VSNL1P62760 191 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SEPT6Q14141 434 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPARCL1Q14515 664 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MMEL1Q495T6 779 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HVCN1Q96D96 273 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 P4HA2O15460 535 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TOM1L1O75674 476 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BCAR1P56945 870 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 AMACRQ9UHK6 382 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RASA4BC9J798 803 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RASA4O43374 803 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MMEP08473 750 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.314e-8■■■■■ 30.9
RAB11FIP3-201ENST00000262305 WDR91A4D1P6 747 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRT38O76015 456 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SNCBQ16143 134 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TTC1Q99614 292 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CDC42EP1Q00587 391 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PKN1Q16512 942 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GMCL1Q96IK5 515 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAGEB2O15479 319 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GPRASP2Q96D09 838 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NCOA4Q13772 614 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 COG7P83436 770 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SNAPC2Q13487 334 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DBN1Q16643 649 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATG16L1Q676U5 607 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.317e-9■■■■■ 72.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRT14P02533 472 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SREBF1P36956 1147 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NPEPPSP55786 919 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 STX1BP61266 288 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GPS1Q13098 491 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SNF8Q96H20 258 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HACL1Q9UJ83 578 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ASAP2O43150 1006 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPDYE6P0CI01 402 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF185O15231 689 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C18orf8Q96DM3 657 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VPS39Q96JC1 886 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TNIP3Q96KP6 325 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 COPEO14579 308 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GH1P01241 217 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRT3P12035 628 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RBP5P82980 135 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ST3GAL1Q11201 340 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DCLK2Q8N568 766 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMX2Q9Y320 296 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC4A1P02730 911 aa23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms