RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 RALAP11233 206 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 RDM1Q8NG50 284 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SPDL1Q96EA4 605 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ZBTB18Q99592 522 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DPYSL4O14531 572 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CSPG5O95196 566 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 KCNJ6P48051 423 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CDK17Q00537 523 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DRP2Q13474 957 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 VEPH1Q14D04 833 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 AFG1LQ8WV93 481 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 THEGQ9P2T0 379 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MGEA5O60502 916 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 GANCQ8TET4 914 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 KRT14P02533 472 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 PGBD4Q96DM1 585 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MMEP08473 750 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SUN2Q9UH99 717 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 OCRLQ01968 901 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SMIM5Q71RC9 77 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TTC17Q96AE7 1141 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SP110Q9HB58 689 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FAM205CA6NFA0 338 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FMO5P49326 533 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 EMC2Q15006 297 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SLC18A3Q16572 532 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FSCBQ5H9T9 825 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TTC8Q8TAM2 541 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 GGA3Q9NZ52 723 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CYP26A1O43174 497 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SNX2O60749 519 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 GPS1Q13098 491 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 FGD4Q96M96 766 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CPB1P15086 417 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 RPA1P27694 616 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 MMP14P50281 582 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 KRT33BQ14525 404 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TRIM15Q9C019 465 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 NCK2O43639 380 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 GIPC2Q8TF65 315 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TECPR2O15040 1411 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 IL18RAPO95256 599 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CDH6P55285 790 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 COPS2P61201 443 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 RAET1EQ8TD07 263 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 C18orf8Q96DM3 657 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 APOL1O14791 398 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRE-201ENST00000254667 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 56.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms