RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-201ENST00000253024 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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TRIM28-201ENST00000253024 SLC20A2Q08357 652 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RASA3Q14644 834 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC114Q96M63 670 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CARD9Q9H257 536 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 NCANO14594 1321 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CCNE2O96020 404 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC172P0C7W6 258 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 NEK9Q8TD19 979 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF536O15090 1300 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CFHP08603 1231 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 KIF22Q14807 665 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PPP2R5AQ15172 486 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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TRIM28-201ENST00000253024 PLS3P13797 630 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ICE2Q659A1 982 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RMDN3Q96TC7 470 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 RIPK3Q9Y572 518 aa22.89■■□□□ 1.26
TRIM28-201ENST00000253024 CES2O00748 559 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CNGA1P29973 690 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 FMO1Q01740 532 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 PRKG1Q13976 671 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 SLC15A2Q16348 729 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CHST7Q9NS84 486 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CNTNAP1P78357 1384 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 DNM1LO00429 736 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 TRAPPC3O43617 180 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 MTMR3Q13615 1198 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 FAM151AQ8WW52 585 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 INTUQ9ULD6 942 aa22.89■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 RPTORQ8N122 1335 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CYP11B1P15538 503 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ACOT2P49753 483 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 MCTP2Q6DN12 878 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CEP170P1Q96L14 293 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 NPTX2P47972 431 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 MTMR2Q13614 643 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 PHF2O75151 1096 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 GDAP1Q8TB36 358 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.87■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CHKAP35790 457 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 PTGIRP43119 386 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 WNT7BP56706 349 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 STK24Q9Y6E0 443 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 PSMC4P43686 418 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 RTN2O75298 545 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 PIAS1O75925 651 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 PDE6CP51160 858 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 BIRC3Q13489 604 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 KAZNQ674X7 775 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 ANO5Q75V66 913 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM28-201ENST00000253024 GPATCH11Q8N954 259 aa22.86■■□□□ 1.25
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