RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216361.8

COCH-201, Transcript of cochlin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COCH, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-201ENST00000216361 CYP1A2P05177 515 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 SLC8A1P32418 973 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.15■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 TP73O15350 636 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 STAT2P52630 851 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 CCDC38Q502W7 563 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 BTBD6Q96KE9 485 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 NUP85Q9BW27 656 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 LRRC19Q9H756 370 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 TMEM206Q9H813 350 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 USP20Q9Y2K6 914 aa22.14■■□□□ 1.14
COCH-201ENST00000216361 SPOPO43791 374 aa22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SNX3O60493 162 aa22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 TRAF1Q13077 416 aa22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 PADI6Q6TGC4 694 aa22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CCDC63Q8NA47 563 aa22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 AAASQ9NRG9 546 aa22.14■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ECEL1O95672 775 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 PODNQ7Z5L7 613 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SLCO2A1Q92959 643 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 NOD2Q9HC29 1040 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ACP6Q9NPH0 428 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 NF2P35240 595 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 PDE6CP51160 858 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 FMO1Q01740 532 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CCDC25Q86WR0 208 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.13■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 PMM2O15305 246 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CYP26A1O43174 497 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ELF1P32519 619 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RWDD2BP57060 319 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CALCOCO2Q13137 446 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RASA3Q14644 834 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 LONRF1Q17RB8 773 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ACCSQ96QU6 501 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 WHRNQ9P202 907 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ALCAMQ13740 583 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 E2F5Q15329 346 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CCDC174Q6PII3 467 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CFAP73A6NFT4 308 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ECE1P42892 770 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 MXI1P50539 228 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 FSCN2O14926 492 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 NPR1P16066 1061 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RIPK1Q13546 671 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 DACT2Q5SW24 774 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SHC3Q92529 594 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ZNF653Q96CK0 615 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 SERPINB12Q96P63 405 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.11■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 MAPK13O15264 365 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 CLDN3O15551 220 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 VSTM1Q6UX27 236 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 RIT2Q99578 217 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 USP21Q9UK80 565 aa22.1■■□□□ 1.13
COCH-201ENST00000216361 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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