RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf225Q9D7D1 332 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnga3Q9JJZ8 631 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bpifb9bA2AJD1 591 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lgr6Q3UVD5 967 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Oog4Q4G0C7 502 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Six1Q62231 284 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bank1Q80VH0 783 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bpifb9aQ80XI7 591 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc169Q8BXX9 214 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pnma1Q8C1C8 353 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tdrd1Q99MV1 1172 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt17Q9QWL7 433 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TazI7HJS2 263 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10436L7N1Y3 520 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fgfr2P21803 821 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RxrbP28704 520 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 IvlP48997 467 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnot7Q60809 285 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc186Q8C9S4 917 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MesdQ9ERE7 224 aa24.2■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm382B1AXN3 1250 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Alkbh1P0CB42 389 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LipeP54310 759 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rps6P62754 249 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Npdc1Q64322 332 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 EtnpplQ8BWU8 499 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pkn2Q8BWW9 983 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdha5Q91Y15 934 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mipol1Q9D9F8 279 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cntn6Q9JMB8 1028 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RptorQ8K4Q0 1335 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Msh2P43247 935 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rufy4Q3TYX8 563 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc33Q3ULW6 985 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rccd1Q8BTU7 377 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mill1Q8HWE7 395 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cgref1Q8R1U2 281 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MycbpQ9EQS3 103 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mettl1Q9Z120 268 aa24.19■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spire2Q8K1S6 718 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gps2Q921N8 327 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mis12Q9CY25 206 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnot8Q9D8X5 292 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 IdeQ9JHR7 1019 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnaseh1O70338 285 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Palb2Q3U0P1 1104 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tcf12Q61286 706 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf771Q8BJ90 317 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 JmyQ9QXM1 983 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Phf2Q9WTU0 1096 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpinb6cW4VSP4 379 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mia3Q8BI84 1930 aa24.18■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 6030498E09RikB1AX85 169 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rint1Q8BZ36 792 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp37Q8C0R0 979 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ciapin1Q8WTY4 309 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Entpd5Q9WUZ9 427 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sbf2E9PXF8 1872 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sema5aQ62217 1077 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Xlr3bQ6P205 226 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ntrk3Q6VNS1 825 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd248Q91V98 765 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930550L24RikQ99PA7 320 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CsadQ9DBE0 493 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp29Q9ES63 869 aa24.17■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Patl2A2ARM1 529 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21973F6WEZ7 68 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ifnb1P01575 182 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GssP51855 474 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mfsd14aP70187 490 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdlim7Q3TJD7 457 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tgoln2Q62314 363 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dnajc28Q8VCE1 385 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mms22lB1AUR6 1238 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Enoph1Q8BGB7 257 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmx4Q8C0L0 335 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sv2aQ9JIS5 742 aa24.16■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pitpnm1O35954 1243 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spdye4aQ5IBH6 268 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 B4galnt4Q766D5 1034 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nsun6Q7TS68 476 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tor4aQ8BH02 426 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Elmo3Q8BYZ7 720 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Epc2Q8C0I4 808 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mcur1Q9CXD6 340 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 H2-OaQ9QWV1 250 aa24.15■■□□□ 1.46
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Casq2O09161 415 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.2 ms