RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdc25aP48964 514 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Foxp2P58463 714 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Togaram2Q3TYG6 1002 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zpbp2Q6X786 326 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ints8Q80V86 995 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PimregQ8BFY7 231 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C130026I21RikQ8C898 291 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp2a1Q8R429 994 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pde6cQ91ZQ1 861 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tom1l1Q923U0 474 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dusp21Q9D9D8 189 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DmgdhQ9DBT9 869 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ltbp2O08999 1813 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Idh1O88844 414 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcna3P16390 528 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alox15P39654 663 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ClgnP52194 611 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasgrf2P70392 1189 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5592Q3V0A6 857 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Jade3Q6IE82 823 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spire2Q8K1S6 718 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gstm4Q8R5I6 218 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Angel1Q8VCU0 667 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rabep2Q91WG2 554 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdha10Q91Y20 946 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl35Q9CZ49 574 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem68Q9D850 329 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PpihQ9D868 188 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mipol1Q9D9F8 279 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufa13Q9ERS2 144 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ecel1Q9JMI0 775 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt17Q9QWL7 433 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TicrrQ8BQ33 1889 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgap42B2RQE8 841 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3127E9Q9P5 263 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3453K7N724 263 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nedd9O35177 833 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tp53P02340 387 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eya3P97480 510 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pde1bQ01065 535 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bnip1Q6QD59 228 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nudt13Q8JZU0 352 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nrbp2Q91V36 499 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rfc4Q99J62 364 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galntl5Q9D4M9 431 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kat2aQ9JHD2 830 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Astn1Q61137 1302 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp31E9Q6Y8 1344 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp984A2A7A2 547 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp51B1AY15 661 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kif6E9PX57 802 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NumblO08919 604 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gsta3P30115 221 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HpdP49429 393 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam83bQ0VBM2 1012 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Miga1Q4QQM5 600 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atl2Q6PA06 583 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Onecut3Q8K557 490 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snf8Q9CZ28 258 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 JmyQ9QXM1 983 aa10.61□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bicdl1A0JNT9 577 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lonrf2B2RT44 518 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ildr2B5TVM2 661 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifit1bl2Q3U687 466 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm14685Q52KH6 695 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snx19Q6P4T1 997 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ankfy1Q810B6 1169 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clec4gQ8BNX1 294 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc7bE9Q6P5 843 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xrcc5P27641 732 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cav1P49817 178 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rtkn2Q14B46 604 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ag2Q3UPL5 249 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BC051142Q3V0M8 400 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ntrk3Q6VNS1 825 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam111aQ9D2L9 613 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt15Q9D2N8 638 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc130Q9D516 385 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myl7Q9QVP4 175 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vav3Q9R0C8 847 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nup188Q6ZQH8 1759 aa10.6□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 JrklB2RRL2 523 aa10.59□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp266E9Q2S7 604 aa10.59□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ikzf1Q03267 517 aa10.59□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cntn3Q07409 1028 aa10.59□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf113a2Q14B01 337 aa10.59□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 IgflQ6B9Z0 140 aa10.59□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddhd1Q80YA3 547 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.9 ms