RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	GAL7	P08431	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YMC1	P32331	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YEF1	P32622	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MAL32	P38158	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FET3	P38993	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MTL1	P53214	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MAL12	P53341	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YML096W	Q04489	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PEX30	Q06169	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FEX2	Q08991	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	BTS1	Q12051	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FSH3	Q99369	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	BAR1	P12630	587 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ECM34	P38728	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	GEP4	P38812	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YHR122W	P38829	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YAL037W	P39728	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	NAS2	P40555	220 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PAM16	P42949	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SNO2	P53823	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	DCR2	Q05924	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	MMT2	Q08970	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	AEP3	Q12089	606 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	INP53	Q12271	1107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	HIS5	P07172	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YCL002C	P25565	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CPR3	P25719	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SRB5	P32585	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TRR2	P38816	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YER010C	P40011	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PUG1	P40100	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YNL195C	P40168	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LOH1	P47055	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ABM1	P47146	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YGL204C	P53089	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SAY1	P53324	424 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	DML1	Q03652	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SMA2	Q04658	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CYK3	Q07533	885 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ATP16	Q12165	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ATP14	Q12349	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RDI1	Q12434	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SOD2	P00447	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	HCM1	P25364	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	BOS1	P25385	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ALG3	P38179	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	GIP2	P40036	548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CAT5	P41735	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SFH5	P47008	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	BNA2	P47125	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	COQ5	P49017	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SKP1	P52286	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ASI3	P53983	676 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SCS7	Q03529	384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	VBA1	Q04301	562 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	IRC13	Q08630	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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