RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 DYMQ7RTS9 669 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TIFAQ96CG3 184 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC7Q99615 494 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 EYSQ5T1H1 3165 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 C22orf31O95567 290 aa23.56■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 FIGNQ5HY92 759 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.56■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 TPH2Q8IWU9 490 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 ERMNQ8TAM6 284 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 APBB2Q92870 758 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 DYDC2Q96IM9 177 aa23.55■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.55■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 HPS3Q969F9 1004 aa23.54■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 DESI2Q9BSY9 194 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 AKT3Q9Y243 479 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TTC26A0AVF1 554 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM150BA6NC51 233 aa23.54■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 IDEP14735 1019 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 RPA1P27694 616 aa23.54■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 COASYQ13057 564 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 USP38Q8NB14 1042 aa23.54■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.54■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 AMHP03971 560 aa23.53■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TSG101Q99816 390 aa23.53■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.53■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PQJ5 194 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 MED24O75448 989 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 SLITRK3O94933 977 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 VTNP04004 478 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 CASQ1P31415 396 aa23.52■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.367e-7■■■□□ 17.8
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF576Q9H609 170 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 SQORQ9Y6N5 450 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.52■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 WDR81Q562E7 1941 aa23.51■■□□□ 1.35
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SGMS1-210ENST00000619438 E9PMD0 336 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 TLL1O43897 1013 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 STBD1O95210 358 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MYOGP15173 224 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CYP11B2P19099 503 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CD52P31358 61 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SLC12A3P55017 1021 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MEA1Q16626 185 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 KIZQ2M2Z5 673 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.51■■□□□ 1.35
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