RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SFN	P31947	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PSMC4	P43686	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNJ6	P48051	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	LIG4	P49917	911 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	AKT3	Q9Y243	479 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	EMSY	Q7Z589	1322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PIAS1	O75925	651 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PSAP	P07602	524 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	YY1	P25490	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TRADD	Q15628	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MYPN	Q86TC9	1320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF653	Q96CK0	615 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GGPS1	O95749	300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CLCN3	P51790	818 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DYNLT1	P63172	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DRP2	Q13474	957 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	NETO2	Q8NC67	525 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP26A1	O43174	497 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RARRES1	P49788	294 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCL15	Q16663	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MMP19	Q99542	508 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PFAS	O15067	1338 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SPOP	O43791	374 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GNA14	O95837	355 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP2B6	P20813	491 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KLRC1	P26715	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ACTR2	P61160	394 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PTK2	Q05397	1052 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SUFU	Q9UMX1	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP2A1	O14983	1001 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GRAP2	O75791	330 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CTSH	P09668	335 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PBX1	P40424	430 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP120	Q8N960	986 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PQC6	194 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	IFNB1	P01574	187 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	WEE2	P0C1S8	567 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SLCO1A2	P46721	670 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SMTN	P53814	917 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT83	P78385	493 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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