RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	C5orf60	A6NFR6	353 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	AGPS	O00116	658 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CHMP2A	O43633	222 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	HAUS5	O94927	633 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TDP2	O95551	362 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PON1	P27169	355 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TMOD1	P28289	359 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PRDX5	P30044	214 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINB4	P48594	390 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ERVK-9	P63128	1117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SURF1	Q15526	300 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RASIP1	Q5U651	963 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	POTEB	Q6S5H4	581 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	BRINP3	Q76B58	766 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NLRX1	Q86UT6	975 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PDIK1L	Q8N165	341 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	INPP5D	Q92835	1189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CD248	Q9HCU0	757 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PDP2	Q9P2J9	529 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MID2	Q9UJV3	735 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GYG2	O15488	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ACSL3	O95573	720 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MT-ND3	P03897	115 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CALB1	P05937	261 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	BMP3	P12645	472 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ACTN1	P12814	892 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	P4HA1	P13674	534 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GJC1	P36383	396 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SLCO1A2	P46721	670 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	VAMP7	P51809	220 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	AP2B1	P63010	937 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EPHA7	Q15375	998 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NFIL3	Q16649	462 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	HYI	Q5T013	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF398	Q8TD17	642 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MIEF2	Q96C03	454 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NUP85	Q9BW27	656 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MRGBP	Q9NV56	204 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C5	P01031	1676 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TJP1	Q07157	1748 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM120B	A0PK00	339 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CLIC2	O15247	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RPS6KA4	O75676	772 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	STAM2	O75886	525 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	KRT37	O76014	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ANP32D	O95626	131 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CFB	P00751	764 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MYBL2	P10244	700 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PDHB	P11177	359 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CYP11B2	P19099	503 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MARK3	P27448	753 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CNGA1	P29973	690 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PEX19	P40855	299 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CD151	P48509	253 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	JAK3	P52333	1124 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	AP3M2	P53677	418 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RAD23B	P54727	409 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81

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