RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 CREG2Q8IUH2 290 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 RAD54LQ92698 747 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KIFAP3Q92845 792 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 MASTLQ96GX5 879 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 CEP63Q96MT8 703 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC77Q9BR77 488 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 SH2D4AQ9H788 454 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 SMIM22K7EJ46 135 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 O00370 1275 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 FAM200BP0CF97 657 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ATP6V1C1P21283 382 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 RXRBP28702 533 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 HSD17B3P37058 310 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 IFNAR2P48551 515 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KIF11P52732 1056 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 HERVK_113P62684 666 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 CDK17Q00537 523 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 TTI2Q6NXR4 508 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 SMIM5Q71RC9 77 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 LONP2Q86WA8 852 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 NEK9Q8TD19 979 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 AMNQ9BXJ7 453 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 PANK4Q9NVE7 773 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 DNM3Q9UQ16 869 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 AFF2P51816 1311 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC160A6NGH7 325 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 H0YIN7 160 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KRIT1O00522 736 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KCNA3P22001 575 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 SEPT6Q14141 434 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC80Q76M96 950 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 COA7Q96BR5 231 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 INTUQ9ULD6 942 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SEH1L-210ENST00000592582 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 DPPA5A6NC42 116 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 PP2D1A8MPX8 630 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 KCNK3O14649 394 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 BACH1O14867 736 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 CYTH3O43739 400 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 CHN1P15882 459 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 DRD4P21917 467 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 CDC25CP30307 473 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 STX2P32856 288 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 ARMC3Q5W041 872 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 DYMQ7RTS9 669 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 MRIQ9BWK5 157 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 NDST4Q9H3R1 872 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 ZWILCHQ9H900 591 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 NYAP2Q9P242 653 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.4□□□□□ -1.39
SEH1L-210ENST00000592582 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms