RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592374.5

MUM1-215, Transcript of melanoma associated antigen (mutated) 1, human

TSL 2

Gene MUM1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUM1-215	ENST00000592374	TSPAN1	O60635	241 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	GALT	P07902	379 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	GLRA2	P23416	452 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	CAPS	Q13938	189 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	KCNC3	Q14003	757 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	NOTUM	Q6P988	496 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	S1PR5	Q9H228	398 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	MED24	O75448	989 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	IGSF21	Q96ID5	467 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	GBP3	Q9H0R5	595 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	CXCL14	O95715	111 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	ITGA4	P13612	1032 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	RPA1	P27694	616 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	VPS52	Q8N1B4	723 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MUM1-215	ENST00000592374	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CPB2	Q96IY4	423 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CSRNP2	Q9H175	543 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	KIF3A	Q9Y496	699 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	IPP	Q9Y573	584 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ALDH2	P05091	517 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	MUT	P22033	750 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CA8	P35219	290 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	SLC11A1	P49279	550 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	GIT2	Q14161	759 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	AMHR2	Q16671	573 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ZBP1	Q9H171	429 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	STK39	Q9UEW8	545 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	DDHD2	O94830	711 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	POTEG	Q6S5H5	508 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	HACE1	Q8IYU2	909 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CASP10	Q92851	521 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	POMC	P01189	267 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CTSA	P10619	480 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	IRAK3	Q9Y616	596 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	PDIA5	Q14554	519 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	NBR1	Q14596	966 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	PADI6	Q6TGC4	694 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	RNF39	Q9H2S5	420 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	POMK	Q9H5K3	350 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	NR2E1	Q9Y466	385 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ARL5C	A6NH57	179 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	INPPL1	O15357	1258 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	B4GALT3	O60512	393 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	BRD1	O95696	1058 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CYP11B2	P19099	503 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	MTMR3	Q13615	1198 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MUM1-215	ENST00000592374	FAM186A	A6NE01	2351 aa		27.65	■■■□□ 2.02

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