RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP1Q07960 439 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 CHADLQ6NUI6 762 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 COPS5Q92905 334 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.31■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 MARK3P27448 753 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 CAPSQ13938 189 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 GJB7Q6PEY0 223 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ZPBP2Q6X784 338 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TSC1Q92574 1164 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TRPC6Q9Y210 931 aa24.3■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 A0A087X0T9 212 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 FAM228BP0C875 321 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 IRF5Q13568 498 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PPTC7Q8NI37 304 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 UBXN4Q92575 508 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TFR2Q9UP52 801 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 SIP14410 1827 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ASAP2O43150 1006 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 NAB2Q15742 525 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TRIM50Q86XT4 487 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 MAML3Q96JK9 1138 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 FAM81BQ96LP2 452 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 KATNBL1Q9H079 304 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.29■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 EVI5O60447 810 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TADA3O75528 432 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TFDP1Q14186 410 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 NOX5Q96PH1 765 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.28■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PPFIA4O75335 1185 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 GPC3P51654 580 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 AMPD2Q01433 879 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 PSMD6Q15008 389 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 TINF2Q9BSI4 451 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 INTUQ9ULD6 942 aa24.27■■□□□ 1.48
USP36-218ENST00000590546 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 CLDN10P78369 228 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MAP7D2Q96T17 732 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 NAGPAQ9UK23 515 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 A0A0B4J269 797 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MAGEB2O15479 319 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 INHBEP58166 350 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 FNBP1Q96RU3 617 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 GPR88Q9GZN0 384 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 COL1A2P08123 1366 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 LGALS2P05162 132 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MFAP3P55082 362 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 KIF22Q14807 665 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 RAB20Q9NX57 234 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.24■■□□□ 1.47
USP36-218ENST00000590546 POU5F1BQ06416 359 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms