RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 EPCAMP16422 314 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 MTHFRP42898 656 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 PTPN21Q16825 1174 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 C8orf76Q96K31 380 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 RNF39Q9H2S5 420 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 POMKQ9H5K3 350 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 NR2E1Q9Y466 385 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 ARL5CA6NH57 179 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 EFEMP2O95967 443 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 DSC1Q08554 894 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 GAD1Q99259 594 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 MARCH5Q9NX47 278 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 HES2Q9Y543 173 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 A0A087WWV3 80 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 A0A1B0GUA9 196 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 MED24O75448 989 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 SOD2P04179 222 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 OR52Z1P0C646 297 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 ATP2B1P20020 1258 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 MLH1P40692 756 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 FBXL18Q96ME1 805 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 NACC1Q96RE7 527 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 KIF2CQ99661 725 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 MIOSQ9NXC5 875 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 B4GALT5O43286 388 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 RPA1P27694 616 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 CLCN4P51793 760 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 HACE1Q8IYU2 909 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 ASIC4Q96FT7 647 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 ZFP42Q96MM3 310 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTIF-206ENST00000588345 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 MUTP22033 750 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 TRAPPC10P48553 1259 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 SCNN1GP51170 649 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 ZNF174Q15697 407 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 FAM187BQ17R55 369 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 ERMNQ8TAM6 284 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 MYO10Q9HD67 2058 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 PIEZO1Q92508 2521 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 KLRC2P26717 231 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 OR1G1P47890 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 TTC38Q5R3I4 469 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 KANK3Q6NY19 840 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 POTEGQ6S5H5 508 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 CABP7Q86V35 215 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 FZD8Q9H461 694 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 USTQ9Y2C2 406 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 NPTXRO95502 500 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 URODP06132 367 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 WEE2P0C1S8 567 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-206ENST00000588345 CYP11B2P19099 503 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms